奥什国立大学孔子学院由新疆师范大学和奥什国立大学合作共建，2013年6月20日揭牌并获批本科学历授予资格，2016年9月成立学院专科部，2018年10月获批研究生学历授予资格，2015年12月成为中亚第一所“示范孔子学院”。孔院本部开设中国学、翻译学、语言学、计算机科学与技术和电子信息工程等五个本科专业；专科部和研究生部开设中国学、翻译学专业。孔院下设奥什国立师范大学、奥什工业大学、国立大学附中3个孔子课堂，国立大学国际关系学院、区域学院两个教学点。孔子课堂则着力开展“汉语+”教学模式。孔院招收社会培训班学员，在校学生共计885人。孔院的特色建设理念为“仁爱至善、情感交融、文化互动、传承发展”。 孔院举办了民乐、武术、书画、剪纸、茶艺、舞蹈多个中国才艺社团，累计开展630多项文化活动，受众达71,000多人次。孔院在各级比赛获奖达260多人次，包括“总统奖学金”等多项大奖。